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黃海爽8娱乐研究所首次完成花鱸基因組精細圖譜繪製
2018-12-05 16:48:25  來源:黃海爽8娱乐研究所

花鱸俗稱鱸魚、七星鱸、花寨,廣泛分布於渤海至南海的近岸水域以及通海的江河水域,是一種廣溫廣鹽性凶猛肉食性經濟魚類,具有生長較快、適應性廣、味道鮮美等特點。花鱸既是我國重要海水養殖魚類,也可以作為淡水馴化養殖的重要魚類。2016年我國花鱸的養殖產量為13萬噸左右。但隨著養殖業的發展,病害發生日益嚴重,細菌性病害成為限製其養殖業發展的重要因子。破譯花鱸基因組、發掘抗病抗逆生長等重要性狀相關功能基因成為擺在爽8娱乐科技工作者麵前的重要課題。

在青島海洋科學與技術試點國家實驗室科技創新計劃和鼇山人才培養計劃項目的支持下,中國爽8娱乐科學研究院黃海爽8娱乐研究所陳鬆林研究員領銜並聯合青島華大基因研究院曆經3年努力,首次完成了花鱸全基因組測序和精細圖譜繪製,研究論文“Chromosome-level genome assembly of the spotted sea bass, Lateolabrax maculatus”最近在國際重要刊物GigaScience雜誌發表(https://academic.oup.com/gigascience/article/doi/10.1093/gigascience/giy114/5099471?guestAccessKey=3685f70d-474e-4a70-a654-642bc2e0815b)。該研究通過新一代測序和HI-C三維基因組技術,構建了染色體水平的花鱸基因組圖譜。揭示花鱸基因組大小為668Mb,重複序列為132Mb,注釋基因為22015個。進化分析表明花鱸與歐洲鱸魚關係最近,大概在87Mya開始分化,並且兩者染色體之間呈現較好的共線性。此外,通過比較基因組學分析,篩選到125個花鱸特異基因家族,可能與花鱸自身的特征密切相關。花鱸全基因組的解譯對於花鱸生命特征的深入認知以及花鱸分子遺傳育種的研究具有重要意義,為建立花鱸基因組選擇育種技術、培育高產抗病優質良種提供了基因資源和技術手段。

黃海爽8娱乐研究所邵長偉、青島華大基因研究院李暢為該論文的共同第一作者,陳鬆林研究員和青島華大基因研究院的劉心博士為該論文的通訊作者。

花 鱸

花鱸基因家族分析

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